신학자들이 성경 전체에서 해석하기 가장 어렵다고 꼽는 대표적인 난해 구절들과 책들은 다음과 같으니 즉

1. 신약성경의 난해 구절
■  베드로전서 3.18~20 (옥에 있는 영들에게 전파): 신학자들이 신약에서 가장 해석하기 어려운 구절 중 하나로 꼽는다는데, 예수님이 죽으신 후 "옥에 있는 영들'에게 가서 말씀을 전하셨다"는 내용으로, 이 '영들'이 누구인지(타락한 천사인지, 노아 시대의 사람들인지)와 '옥'의 의미를 두고 견해가 갈린다고 하나, 천사는 해당되지 않는 것이 천사는 초자연계 존재로서 지식이 월등하므로 그들의 범죄는 고범죄에 해당되어 용서 자체가 불가능입니다. "옥"이라 함은 일정한 한 곳에 집결되어 있다는 정도로 알면 되고, 일단 이렇게 복음이 전해졌으니까 일찍이 복음을 듣지 못한 예컨대 고대인들이 여기서 그 장래가 결정된다고 보아도 무방할 것입니다. 그러나 이세상에서 믿지 않아도 제2차 기회가 있다는 것은 절대 아니니 주의를 요합니다.
■  베드로후서: 이 책은 정경(Canon)으로 인정받은 서신서 중 가장 난해한 책으로 여겨진다고 하고는 하나, 복잡한 신학적 이슈들이 얽혀 있다뿐이지 우리의 구원 문제와 직결되는 것은 아니기에 그냥 넘어가도 상관 없습니다.
■  마태복음 7.21~23 (불법을 행하는 자들아): 주님의 이름으로 선지자 노릇을 하고 귀신을 쫓아낸 이들에게 예수님이 "내가 너희를 도무지 알지 못한다"고 말씀하신 장면입니다. 구원과 행함의 관계, 그리고 '믿음'의 본질에 대해 깊은 신학적 논쟁을 불러일으킨다 하나, 지난 때에는 제아무리 능력을 행했다 해도 그 능력 자체가 우리 구원을 담보하는 것은 아니기에 이 말씀은 상식 수준에서 얼마든 이해할 수 있는 일입니다.
■  고린도전서 15.29 (죽은 자들을 위한 세례): 초기 그리스도인들이 죽은 사람을 대신해 세례를 받았다는 암시가 있어, 이 관습의 실체와 바울의 의도에 대해 학자들 사이에서 의견이 분분하다고 하나 물 속에 들어갈 수 없는 중환자가 회개했을 경우 있을 수 있는 일입니다.
2. 구약성경의 난해 부분
■  창세기 6:1-4 (네피림과 하나님의 아들들): '하나님의 아들들'이 사람의 딸들과 결혼하여 '네피림'을 낳았다는 기록은 그 정체에 대해 고대부터 현대까지 끊임없는 논쟁의 대상이라고 하나 여기서 '하나님의 아들들'이라 함은 하나님 친히 만드신(낳고 낳음으로써 생긴 것이 아닌) 신령한 생물을 가리킵니다. 즉 악령들이 그 초능력으로 인간 남자로 변신해서 생산해낸 인간 종자인 것. 사탄 패거리 악령들이 인간 세상 통치 차원에서 그런 짓거리를 했던 것이나 불법이므로 해당 악령들은 심판 때까지 유폐형을 당했으나(유다서 1.6) 사탄만은 그가 세상을 현재 지배하고 있는지라 그 소생 네피림이 대신 들어가고 적그리스도로서 오늘날 곧 풀려날 예정입니다.
■  다니엘 9.24-27 (칠십 이레): 이 예언적 구절은 역사적 성취 시점과 상징적 의미를 두고 해석이 매우 복잡하여 신학적 논란이 많다고 합니다.
■  에스겔 40장 이후 (새 성전 환상): 에스겔이 본 거대한 성전 환상은 그 물리적 실체나 미래적 의미를 주석하기가 대단히 까다로운 부분으로 알려져 있다고 함.
■  신명기 28:53-57 (자녀의 살을 먹는 재앙): 전쟁과 포위 속에서 극심한 굶주림으로 부모가 자녀를 먹게 된다는 비극적인 묘사는 신학적으로나 윤리적으로 직면하기 가장 힘든 구절 중 하나로 꼽힌다고 하나 아담 범죄로 동물적 육체가 된 이상 성경 기록이라 해서 예외일 수는 없는 것. 
3. 난해한 책 (전체)
■  히브리서: 구약의 제사 제도와 신약의 복음을 유기적으로 연결해야 하므로, 저자가 누구인지부터 시작해 구약 인용 방식까지 학문적 난도가 매우 높은 책으로 알려져 있다고 합니다.
■  요한계시록: 상징과 환상이 가득하여 세대주의적 해석부터 역사주의적 해석까지 수많은 학설이 존재하며, 성경 전체에서 가장 오해와 논란이 많은 책으로 지목된다고 합니다. 
4. 그 밖에 "난해하다"고 하는 부분
■  빌립보서 2:5-11(비움의 기독론)과 로마서 7장을 들고 있는데 "자기를 비우셨다"는 대목이 어렵다니 참으로 어이가 없습니다. 그러나 로마서 7장에서 말하는 "나"의 정체를 두고  "그 신학적 깊이 때문에 학자들 사이에서 가장 많이 토론되는 부분들"이라는데, 사실상 우리 구원과 유일하게 직결된 것이 이 로마서 7장인 것입니다. 사실을 말하면, "난해한 것"이 아니라 사탄이 교회를 일대 참사의 함정으로 몰아 넣기 위해 계획적으로 파 놓은 죽음의 구덩이인 것입니다. 바벨론 신학의 유일한 정체라 해도 좋습니다.